Christian J. Bonath absolvierte sein Musikstudium mit Schwerpunkt Dirigieren an den Musikhochschulen in Saarbrücken, Mainz und Hannover. Wichtige Anregungen verdankt er den Dirigenten Matthias Breitschaft, Max Pommer, Ralf Otto und Manfred Cordes. Meisterkurse führten ihn u. a. zu Frieder Bernius und Sylvain Cambreling.
Von 2008 bis 2012 wirkte er als Chorleiter für den „Knabenchor Gütersloh”. 2012 wurde er zum künstlerischen Leiter des Knabenchores capella vocalis nach Reutlingen berufen. Zudem wirkte er als Dozent an der Hochschule für Musik in Mainz. Als Spezialist für Alte Musik verantwortete er zahlreiche Erstaufführungen und Wiederentdeckungen (Graupner, Telemann, Mattheson, Heinichen, J.C.F. Bach u.a), die ihn auch international bekannt gemacht haben.
Konzerttourneen führten ihn als Dirigent nach Asien, Südamerika und durch viele Länder Europas. Auf seine Initiative gründeten sich das Ensemble Paulinum und das Barockorchester Pulchra Musica. Eine rege Konzert- und Kompositionstätigkeit, Einladungen zu renommierten Festivals und Einspielungen für ZDF, SWR, DW, DLF, DR ergänzen sein künstlerisches Wirken. Seit September 2022 wirkt Bonath als Nachfolger von Matthias Liebich als neuer Domkapellmeister an der Dresdner Kathedrale und als Chorleiter der Dresdner Kapellknaben.